Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms