Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms