Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms