Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms