Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COPG2Q9UBF2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms