Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms