Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms