Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms