Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms