Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC52A2Q9HAB3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A2Q9HAB3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms