Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MTMR12Q9C0I1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms