Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXQ1Q9C009 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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