Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM54Q9BYV2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms