Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIFKQ9BYG3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms