Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LARP6Q9BRS8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms