Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMTK3Q96Q04 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms