Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85AQ96PX6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms