Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20AQ96MK3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms