Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms