Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms