Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM47Q96LD4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms