Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms