Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms