Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED12Q93074 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MED12Q93074 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MED12Q93074 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED12Q93074 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED12Q93074 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED12Q93074 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED12Q93074 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED12Q93074 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms