Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms