Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDAQ92838 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDAQ92838 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDAQ92838 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms