Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RB1CC1Q8TDY2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms