Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWDEQ8N2E2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms