Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX90

SKA3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA3Q8IX90 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKA3Q8IX90 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms