Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms