Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETXQ7Z333 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms