Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTF1AQ7RTS3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTF1AQ7RTS3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms