Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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