Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG3Q6UXM1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms