Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC174Q6PII3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms