Protein–RNA interactions for Protein: Q5K131

CLLU1, Chronic lymphocytic leukemia up-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLLU1Q5K131 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLLU1Q5K131 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms