Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47AQ5JRC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47AQ5JRC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms