Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAVIN4Q5BKX8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms