Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LONRF3Q496Y0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms