Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A8Q2Y0W8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A8Q2Y0W8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms