Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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