Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 FLNA-213ENST00000466325 828 ntTSL 213.94□□□□□ -0.182e-11■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-205ENST00000586420 579 ntTSL 513.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-209ENST00000590688 527 ntTSL 513.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-203ENST00000586136 617 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 FLNA-205ENST00000415241 704 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-208ENST00000588551 789 ntTSL 312.44□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-210ENST00000591061 502 ntTSL 411.51□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-213ENST00000592759 550 ntTSL 411.18□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 HARS-209ENST00000506579 3482 ntTSL 210.4□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 TMEM94-221ENST00000581723 582 ntTSL 210.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 31
SF3B4Q15427 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 POP4-202ENST00000585603 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 BOD1L1-205ENST00000509897 190 ntTSL 33.84□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 31
SF3B4Q15427 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 RNPEP-203ENST00000447312 1166 ntTSL 511.47□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 RNPEP-206ENST00000471105 2093 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 RNPEP-213ENST00000492849 958 ntTSL 59.65□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 31
SF3B4Q15427 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-12■■■■■ 31
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SF3B4Q15427 MYO15B-233ENST00000612587 4189 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 VPS33B-207ENST00000557470 529 ntTSL 55.32□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.968e-8■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 DNAJC2-208ENST00000475065 1952 ntTSL 1 (best)2.21□□□□□ -2.068e-8■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 SLC38A5-202ENST00000416711 708 ntTSL 511.46□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.057e-13■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 AHSA2-205ENST00000471542 1971 ntTSL 213.12□□□□□ -0.317e-13■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 NDRG2-265ENST00000557182 559 ntTSL 412.67□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 NDRG2-257ENST00000556688 583 ntTSL 512.17□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-259ENST00000556924 603 ntTSL 412.13□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-230ENST00000554398 565 ntTSL 411.8□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-233ENST00000554472 587 ntTSL 411.02□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-214ENST00000553442 639 ntTSL 510.64□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-246ENST00000555695 823 ntTSL 510.62□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-219ENST00000553741 842 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-248ENST00000555767 560 ntTSL 49.74□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-249ENST00000555869 871 ntTSL 59.71□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-267ENST00000557264 593 ntTSL 48.76□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 30.9
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SF3B4Q15427 NDRG2-264ENST00000557169 851 ntTSL 28.41□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-234ENST00000554483 561 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-229ENST00000554379 553 ntTSL 46.75□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 30.9
SF3B4Q15427 NDRG2-262ENST00000557149 583 ntTSL 26.09□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 30.9
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