Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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BRD3Q15059 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRD3Q15059 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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