Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPD2Q15021 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPD2Q15021 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms