Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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