Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NAE1Q13564 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NAE1Q13564 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms