Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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