Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN4PQ13434 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms