Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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