Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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NR1H3Q13133 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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NR1H3Q13133 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NR1H3Q13133 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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